ASIMOV. Aula de simulación y modelado virtual de procesos bio-moleculares

Metas alcanzadas en esta fase

Durante la primera edición del proyecto, se llevó a cabo un estudio bibliográfico detallado de la glucolisis; se seleccionaron las descripciones formales más idóneas, en términos de ecuaciones y se estudiaron diferentes juegos de valores paramétricos obtenidos experimentalmente bajo diferentes situaciones fisiológicas. Se inició el abordaje de los objetivos 1 y 2, proponiéndose un primer diseño del “workflow” a emplear y un posible protocolo de descripción formal de los sistemas metabólicos. Respecto al objetivo 3, se definieron las librerías a emplear y se ensayó un prototipo preliminar de código para llevar a cabo la integración de ecuaciones diferenciales y se discutieron algunos problemas teóricos asociados (p.e.: valores negativos de concentración de metabolitos).

Camino por recorrer

Es obvio que se trata de un proyecto ambicioso y complejo cuyo abordaje ha de ser progresivo. En este momento es prioritario definir una adecuada estructura y representación interna de los datos experimentales. Asimismo sería prioritario disponer de un primer prototipo funcional de motor de integración capaz de operar con datos externos. Finalmente, será necesario disponer también de una interfaz gráfica, básica, de interacción con la persona usuaria.